Les notebooks ont souvent été cités comme facteur clef de la science ouverte en favorisant la reproductibilité. Si la "reproductibilité" des résultats est la principale qualité recherchée et mise en avant dans plusieurs études (Pimentel et al., 2021; Samuel & Mietchen, 2022), les travaux montrent qu'elle est loin d'être atteinte dans la plupart des notebooks disponibles publiquement, notamment sur GitHub .
Pour parvenir à une reproductibilité ou une reproduction, il est important que les notebooks, les données et l'environnement de travail associé s'insèrent eux-mêmes dans les principes FAIR. Aujourd'hui, peu de notebooks respectent ces principes, par exemple il peut manquer une licence, un DOI ou les métadonnées sont incomplètes.
