Résumé de section

  • Cet exercice vous permet de tester l'anonymisation d'un fichier DICOM à l'aide de la librairie PyDicom.

    • Présentation

      Nous allons voir de façon concrète un exemple d'anonymisation d'une image DICOM. Pour ce faire, nous avons besoin de trois éléments :

      Fichier DICOM

      Le fichier DICOM contenant les tags à anonymiser.

      Librairie PyDicom

      Le langage permettant de manipuler les métadonnées DICOM.

      Jupyter NoteBook

      L'environnement pour exécuter les commandes d'anonymisation sur le fichier DICOM.

      Nous avons installé tous ces éléments dans un espace dédié du site Binder qui permet de créer, partager et exécuter des environnements de NoteBooks directement à partir d'un navigateur web, sans nécessiter d'installation locale.

      En temps normal, dans le cadre d'un travail de recherche, il est nécessaire d'utiliser un environnement sécurisé propre à votre laboratoire. Ne travaillez jamais avec des données sensibles dans des environnements accessibles publiquement !

      Tout est prêt, vous n'avez qu'à cliquer sur le bouton ci-dessous pour ouvrir Binder dans un nouvel onglet.

      Ouvrir Binder

      Le chargement de la page peut être long à cause de la génération des fichiers (pour suivre l'avancement, cliquez sur le lien "Show").

      En parallèle, suivez le tutoriel ci-dessous pour découvrir l'interface et la manipulation des tags DICOM.