• Ouvrir

    • LE SAVIEZ-VOUS ?

      Dans la plupart des recherches qui produisent des données, les logiciels et les codes sont des résultats de recherche aussi importants que les données.

      OBJECTIF PÉDAGOGIQUE

      À l'issue de cette rubrique, vous serez en mesure de définir le degré et les modalités d'ouverture de vos codes et logiciels et vérifier leur adaptation aux principes FAIR.

       DURÉE
                 
        15 minutes


    • Pourquoi ouvrir ?


      L’ouverture des logiciels et des données est indispensable à la reproductibilité scientifique, car elle permet à la communauté de vérifier, réutiliser et répliquer les résultats publiés. Rendre accessibles les codes sources et les jeux de données associés à une recherche constitue une condition nécessaire pour que d’autres chercheurs et chercheuses puissent reproduire les expérimentations, examiner les méthodes employées et construire de nouveaux travaux sur des bases transparentes et vérifiables et éviter la duplication des efforts.

      En effet, l’absence de partage des logiciels et des données reste aujourd’hui un obstacle majeur à la reproductibilité des expériences scientifiques.
      L’ouverture conjointe des codes et des données permet non seulement d’auditer les résultats, mais aussi de garantir la confiance dans la science, d’encourager la collaboration et d’améliorer la qualité des recherches.

      En résumé, ouvrir logiciels et données n’est pas seulement une bonne pratique : c’est un pilier fondamental pour assurer la transparence, la vérifiabilité et la progression collective de la recherche scientifique. De plus, l'accès libre aux logiciels encourage l'innovation et l'amélioration continue des méthodes de recherche, bénéficiant ainsi à l'ensemble de la communauté scientifique.

    • Gouvernance des algorithmes, codes et logiciels à INRAE

      Parce qu'ouvrir les données comporte des risques - considérant les codes sources comme des données à part entière - INRAE s'est doté d'une politique de gouvernance des données. Quatre principes fondent les bases de la politique de l'Institut et régissent les décisions à prendre lors du cycle de vie des données et des codes.

      Ces principes forment les axes d'un système de décision cohérent en étudiant une à une les dimensions scientifique (valeurs déontologiques et éthiques), technique (gestion des données mettant en avant les bonnes pratiques à respecter), réglementaire (respect de la législation et des engagements contractuels), et d'innovation (valeur produite pour la société).

      C'est à l'issue d'un examen approfondi selon ces principes que le degré d'ouverture pourra être décidé.

      • Principe 1 : Il faut partager et réutiliser les données, les codes et les algorithmes en respectant les valeurs de la science
      • Principe 2 : Les données, les codes et les algorithmes doivent être gérés en vue de les rendre F.A.I.R.
      • Principe 3 : Les données, les codes et les algorithmes doivent être « aussi ouverts que possible, aussi fermés que nécessaire »
      • Principe 4 : L'ouverture des données, des codes et des algorithmes contribue à l'innovation et à la création de valeur pour la société

      La note intitulée « Principes pour la gouvernance des données, des codes et des algorithmes » vise à énoncer ces principes en définissant le rôle et la responsabilité des acteurs et des actrices. Elle constitue un guide permettant d'identifier les questions qu'il faut se poser afin de mieux les gérer et les valoriser sur la base de critères scientifiques, juridiques, économiques, techniques et de politique scientifique. Elle présente également un processus pour leur instruction en vue d'aboutir à une décision sur les modalités d'ouverture.

      Cette note est accompagnée de fiches techniques consultables sur le portail Science ouverte INRAE fournissant une information pratique. Vous y trouverez notamment les documents de référence tels que :

      • la fiche Rôles et responsabilités qui décrit les rôles et responsabilités des principaux acteurs et actrices INRAE, selon le risque d'ouverture des données.
      • le logigramme qui illustre le principe « Aussi ouvert que possible, pas plus fermé que nécessaire » à travers les aspects juridiques qui conditionnent l'ouverture, le partage ou, au contraire, la fermeture de l'accès aux données.
      • la fiche juridique - Ouverture des données de la recherche qui s'attache à préciser, en complément du logigramme illustrant ce principe, les aspects juridiques qui conditionnent l'ouverture, le partage ou, au contraire, la fermeture de l'accès aux données.

      Vous pouvez également retrouver ces fiches dans le module Gestion et partage des données d'OSCAR dans la rubrique « Puis-je ouvrir les données ? ».

    • Les principes FAIR adaptés aux logiciels

      En 2016, sont publiés les "FAIR Guiding Principles for scientific data management and stewardship", faisant état des quatre principes fondateurs d’une bonne gestion des données, vecteur principal permettant la découverte de connaissances et l’innovation.
      Les auteurs et les autrices s’attachent à donner des lignes directrices pour améliorer la localisation, l’accessibilité, l’interopérabilité et la réutilisation des ressources numériques, en mettant l’accent sur le « machine-actionable » c’est-à-dire sur le fait d’être exploitable par une machine (capacité des systèmes informatiques à trouver, accéder, interopérer et réutiliser les données sans intervention humaine ou avec une intervention humaine minimale).

      Le groupe de travail FAIR for Research Software (FAIR4RS) a adapté les principes FAIR pour la gestion des données scientifiques aux logiciels de recherche.
      Les caractéristiques spécifiques des logiciels - telles que leur exécutabilité, leur nature composite, leur évolution et le versionnement continus - rendent nécessaires la révision et l'extension des principes.
      Découvrez les 17 questions à se poser pour vérifier l'adaptation aux principes FAIR d'un logiciel dans cette ressource DoRANum.

      Institut de l’Information Scientifique et Technique, Institut PASTEUR, & EOSC FAIR-IMPACT. (2024). DoRANum-Enjeux et bénéfices : Les principes FAIR adaptés aux logiciels. DoRANum. https://doi.org/10.13143/0365-XZ76

    • Ce que j'ai retenu

      L’ouverture des algorithmes, codes et logiciels est essentielle à la reproductibilité scientifique, car elle permet de vérifier, réutiliser et construire de nouveaux travaux sur des bases fiables et transparentes. Elle renforce la confiance dans la science, évite les duplications et favorise l’innovation. INRAE a mis en place une gouvernance basée sur quatre principes : partager et réutiliser dans le respect des valeurs scientifiques, rendre les données et logiciels FAIR, appliquer la règle « aussi ouverts que possible, aussi fermés que nécessaire », et contribuer à la création de valeur pour la société. Une note et des fiches techniques accompagnent cette démarche en précisant les rôles, responsabilités et aspects juridiques. Enfin, les principes FAIR ont été adaptés aux logiciels (FAIR4RS), pour tenir compte de leur spécificité : exécutabilité, versionnement et évolution continue.

    • Les étudiants doivent
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