doctorant

Cours signalées avec « doctorant »

Le livret "Soyons accessibles" vise à aider les étudiants et les chercheurs à intégrer la question de l'accessibilité dans leurs travaux scientifiques, tels que mémoires, thèses et publications.

Ce livret contient des informations contextuelles et pratiques, des définitions, des témoignages, ainsi que des liens utiles pour vous accompagner dans votre démarche d'accessibilité.

Cette page est une adaptation du livret réalisé sous la direction du Ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche.

Catégorie: Accessibilité
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Publications scientifiques, Accessibilité numérique
Durée: Format court (< 1h)
Type d'accès: Libre accès
Partenaire: Callisto
Langue: Français

Cette formation en ligne a été conçue pour sensibiliser les jeunes chercheurs inscrits en doctorat aux enjeux de la science ouverte qui vont se présenter à toutes les étapes du parcours de recherche. 

D'une durée de 3h, cette formation permet de comprendre comment diffuser en accès ouvert les données et les résultats des travaux scientifiques pendant la thèse. 

À la suite de cette formation, les bonnes pratiques de science ouverte qui concourent au respect de l’intégrité scientifique seront acquises afin d'être intégrées depuis l’élaboration de la démarche scientifique jusqu’à la diffusion des résultats.

Ce parcours de formation a été créé pour les doctorants d'Aix-Marseille Université mais les contenus s'adressent à l'ensemble de la communauté universitaire et de la recherche.


Chacun des modules ci-dessous est proposé en version française et anglaise.

Catégorie: Science ouverte
Auteur(s) / Formateur(s): Bibliothécaires-formateurs du SCD d'Aix-Marseille Université
Production cours: Mission formation des usagers du SCD d'Aix-Marseille Université
Relecture: Fabien Borget - Aix Marseille Université
Public cible: Doctorants
Date de publication: 5 juillet 2024
Mise à jour: 18 mars 2026
Durée estimée: 3 heures
Licence: CC BY-SA
Citation: Gras, Isabelle, Guardiola, Amélie, Bidaux, Jean-Luc, Allouche, T., Annequin, E., Bayon, Y., Blanchard, F., Capasso, S., Compain, J.-J., Dalmasso, C. M., Decque, N., Del Rio, H., Fayat, C., Guez, L., Mahdjoub, S., Marchelli, M., Mokhtari, F., Moreau, N., Péron, C., … Thibault, C. (2024, juillet 5). Sensibilisation à la science ouverte - Raising awareness of open science. Zenodo.
DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.12665200
Open badge: Non
Catalogue: Oui
Thématique: Science Ouverte, Données de la recherche
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès
Partenaire: Callisto
Langue: Français, Anglais

Est-ce que j'ai le droit de recopier une partie d'un livre dans mon travail ? Et cette image que j'ai trouvée dans un article, est-ce que j'ai le droit de l'utiliser ? On me demande de faire une bibliographie à la fin du mémoire, mais comment ça s'organise exactement ? Qu'est-ce que je dois mettre là-dedans ?

Ces questions, vous vous les êtes sans doute posées, ou alors vous allez très prochainement vous les poser lors de vos études. Que ce soit dans la rédaction d'un dossier, pour rendre un devoir, ou pour écrire votre mémoire, ou même une thèse, vous serez confrontés à ces difficultés. Alors, plutôt que de vous laisser seul face à celles-ci, nous vous proposons d'apprendre ensemble comment les résoudre.

Ce MOOC comprend 4 grands modules qui s'enchaînent de manière logique. Il est donc vivement conseillé de le suivre dans l'ordre proposé :

  1. Connaître les règles de la propriété intellectuelle et du droit d'auteur
  2. Connaître et éviter le plagiat
  3. Citer un document et rédiger une bibliographie
  4. Utiliser Zotero
Catégorie: Partenariats
Auteur(s) / Formateur(s): Marie Latour - Université de la Nouvelle Calédonie
Responsable(s) pédagogique(s): Annaïg Mahé - URFIST de Paris, Rose-Marie Borgès - Université Clermont-Auvergne
Production cours: Viet Jeannaud - Fondation Callisto
Production vidéos: Flyy Lerandy
Public cible: Doctorants, Masterants
Date de publication: 6 octobre 2025
Durée estimée: 4 heures
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Oui
Nombre d'inscrits: 3
Recours à une IA: Transcriptions des vidéos générées par Gladia et nettoyées par Claude Sonnet 4
Catalogue: Oui
Thématique: Méthodologie de la thèse, Éthique et Intégrité scientifique, Aspects juridiques, Outils / logiciels
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription, Ressource éducative libre
Partenaire: Callisto
Langue: Français

This self-paced course will guide you through installing Zotero, exploring its interface, collecting bibliographic references, and managing them. You will also learn how to generate a bibliography with Zotero.


Learning objectives

  1. Install Zotero
  2. Understand its interface
  3. Collect references
  4. Manage references
  5. Manage notes, tags, search, sorting, and duplicates
  6. Import or export in BibTeX or RIS format
  7. Generate a list of bibliographic references
Auteur(s) / Formateur(s): Gabriel Gallezot - Université Côte d'Azur
Production cours: Philippe Jaricot - Université Côte d'Azur
Production vidéos: Philippe Jaricot - Université Côte d'Azur
Public cible: Enseignants Chercheurs, Doctorants, Professionnels de l’information
Date de publication: 10 février 2026
Durée estimée: 3 heures
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Catalogue: Oui
Thématique: Méthodologie de la thèse, Outils / logiciels
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès
Partenaire: Urfist
Langue: Anglais

Cette auto-formation vous permettra d'installer Zotero, de découvrir son interface, de collecter des références bibliographiques et de les gérer. Vous comprendrez aussi comment on peut produire une bibliographie avec Zotero.


Objectifs

  1. Installer Zotero
  2. Comprendre son interface
  3. Collecter des références
  4. Gérer des références
  5. Gérer notes, marqueurs, recherche, tri et doublons
  6. Importer ou exporter au format Bibtex ou Ris
  7. Produire une liste de références bibliographiques
Auteur(s) / Formateur(s): Gabriel Gallezot - Université Côte d'Azur
Production cours: Philippe Jaricot - Université Côte d'Azur
Production vidéos: Philippe Jaricot - Université Côte d'Azur
Public cible: Enseignants Chercheurs, Doctorants, Professionnels de l’information
Date de publication: 13 mars 2022
Mise à jour: 5 février 2026
Durée estimée: 3 heures
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Catalogue: Oui
Thématique: Méthodologie de la thèse, Outils / logiciels
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès
Partenaire: Urfist
Langue: Français

Disquettes, CR-ROM, DVD, cartes SD, clés USB, disques durs externes, cloud computing... Nos façons de stocker nos données évoluent avec les supports. Chaque support a ses avantages et inconvénients en termes de sécurité et de facilité de partage des données.

Vous trouverez ici quelques conseils pour optimiser la sécurité de vos données durant un travail de recherche.

Auteur(s) / Formateur(s): Urfist Méditerranée
Production cours: Viet Jeannaud
Public cible: Chercheurs, Doctorants
Date de publication: 27 février 2017
Mise à jour: 15 janvier 2024
Durée estimée: 20 minutes
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Données de la recherche
Durée: Format court (< 1h)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription, Ressource éducative libre
Partenaire: Urfist
Langue: Français

Les données de recherche font partie des sources nécessaires pour valider les résultats scientifiques. Elles sont donc très importantes et nécessitent une attention particulière tout au long d'un travail de recherche.

Cette initiation vous permet d'en apprendre plus sur les entrepôts de données (data repositories), de comprendre leur utilité, de connaître leurs spécificités et de vous guider dans la recherche de l'entrepôt le plus adapté à votre situation.

Auteur(s) / Formateur(s): Urfist Méditerranée
Production cours: Viet Jeannaud - Fondation Callisto
Public cible: Chercheurs, Doctorants
Date de publication: 10 mars 2022
Mise à jour: 16 mars 2026
Durée estimée: 1 heure
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Science Ouverte, Données de la recherche
Durée: Format moyen (1h - 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: Urfist
Langue: Français
Auteur(s) / Formateur(s): Auréa Cophignon - Université Côte d'Azur
Production cours: Viet Jeannaud - Fondation Callisto
Public cible: doctorants en biologie
Date de publication: 25 juin 2024
Durée estimée: 45 minutes
Prérequis: aucun
Licence: CC BY-NC-SA
Citation: Cophignon, A., & Jeannaud, V. (2024). Rédiger un DMP pour sa thèse en biologie (Version 1). Callisto Formation.
DOI: https://doi.org/10.60538/reaction-dmp-biologie
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Non

Nous vous présentons ici les raisons pour lesquelles il convient d'ouvrir les données de recherche, c'est-à-dire de les rendre accessibles publiquement, afin notamment de permettre la reproductibilité des expériences.

À l'aide d'exemples concrets, nous donnons un certain nombre de raisons (éthiques, pratiques, légales…) d'effectuer la mise à disposition dans des entrepôts de données accessibles à long terme. Nous donnons également quelques pistes afin de mettre à disposition les données de recherche en accès libre.

La présentation est avant tout destinée aux universitaires en informatique théorique mais, du fait des similitudes dans ces différents domaines, les personnes effectuant leur recherche en informatique en général ou même en mathématiques, devraient y trouver bon nombre d'informations utiles.

Catégorie: Informatique
Auteur(s) / Formateur(s): Étienne ANDRÉ - Université Sorbonne Paris Nord, LIPN, CNRS UMR 7030
Production cours: Olivier Lu - Urfist Lyon
Public cible: toute personne effectuant des recherches en informatique théorique, ou plus généralement en informatique ou en mathématiques.
Date de publication: 22 novembre 2022
Durée estimée: 45 min
Prérequis: aucun
Licence: CC BY-NC-SA
Citation: É. André and O. Lu, “Ouvrir les données de recherche en informatique théorique : qu'a-t-on à y gagner ?” Callisto, 2023, doi: 10.60538/OUVRIR_DR_INFORMATIQUE_THEORIQUE.
DOI: https://doi.org/10.60538/ouvrir_dr_informatique_theorique
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Science Ouverte, Données de la recherche
Durée: Format court (< 1h)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: DoRANum
Langue: Français

Ce cours examine en profondeur les cohortes en santé et l'utilisation des données d'imagerie médicale en recherche médicale. Il couvre les enjeux techniques, juridiques et éthiques de l'ouverture des données de cohortes, ainsi que les défis liés à l'évolution des librairies de programmation et de l'environnement d'exécution dans le contexte des pipelines de traitement.

Catégorie: Santé publique
Auteur(s) / Formateur(s): Frédéric Cervenansky - UCBL Research Engineer | CREATIS
Production cours: Viet Jeannaud - Callisto Formation
Public cible: doctorants et ingénieurs en science des données médicales
Date de publication: 16 juin 2023
Durée estimée: 1h
Prérequis: aucun
Licence: CC BY-NC-SA
Citation: Cervenansky, F., & Jeannaud, V. (2024). Cohortes en santé : données ouvertes en imagerie médicale (Version 1). Callisto Formation.
DOI: https://doi.org/10.60538/cohortes-sante
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Science Ouverte, Données de la recherche
Durée: Format moyen (1h - 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: DoRANum
Langue: Français

La production de données de recherche représente un investissement considérable en temps, en ressources et en expertise. Pourtant, sans une documentation appropriée, ces données risquent de perdre leur valeur scientifique à moyen ou long terme, devenant inexploitables même pour leurs propres créateurs.

Ce cours vous permettra de découvrir les différentes formes que peuvent prendre des métadonnées, ainsi que comment les utiliser dans le cadre de références bibliographiques. Au cours de ce module, plusieurs activités vous seront proposées dans la partie Cas pratique (activités nécessitant l'utilisation de Zotero). En cas de réussite de ces activités, un open badge basé sur le référentiel de compétence Oberred vous sera attribué pour la compétence générale "Description des données".


Objectifs pédagogiques

À l'issue de ce cours vous serez en mesure de :
  • Appréhender les concepts de métadonnées, standard de métadonnées et schéma de métadonnées
  • Comprendre les étapes du cycle de vie d’une métadonnée
  • Collecter des métadonnées via un outil de gestion de références bibliographiques (Zotero)
  • Modifier une métadonnée (enrichissement et nettoyage) via un outil de gestion de références bibliographiques (Zotero)
  • Exporter et réutiliser une métadonnée

Programme

  1. Définitions
    1. Préambule de l'information
    2. Qu'est-ce qu'une métadonnée ?
    3. Les métadonnées visibles
    4. Les métadonnées numériques
    5. Les métadonnées externes et embarquées
    6. Les métadonnées structurées
    7. Les standards de métadonnées
    8. Les schémas de métadonnées
  2. Cas pratique
    1. Collecte des données
    2. Traitement des données
    3. Réutilisation des données
Auteur(s) / Formateur(s): Amélie Barrio - Urfist Occitanie, Gabriel Gallezot - MCF Université Côte d'Azur
Production cours: Lucas Ricroch - Urfist de Paris, Viet Jeannaud - Fondation Callisto
Public cible: Tout public
Date de publication: 20 février 2026
Durée estimée: 1 heure
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Oui
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Science Ouverte, Données de la recherche, Outils / logiciels
Durée: Format moyen (1h - 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: Centre de ressources Urfist
Langue: Français

This course module features a number of useful tools for doctoral students e.g. drawing software for figures, transcription tools, mind mapping tools, etc. 

This section also points to training courses available on Callisto for designing media such as GIFs and scientific posters.

Auteur(s) / Formateur(s): Groupe de travail FormaDoct
Production cours: Xavier Divet - Ingénieur pédagogique • Philippe Jaricot - UNIT
Public cible: Doctorants, toutes personnes intéressées par les problématiques IST
Date de publication: 18 septembre 2024
Mise à jour: 16 février 2026
Durée estimée: 3 heures
Prérequis: aucun
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Méthodologie de la thèse
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

Bienvenue dans ce cours dédié au support d'écriture que vous allez utiliser pour votre thèse.

Ce chapitre traite de :

  • L'évaluation des supports d'écriture : Nous vous aidons à choisir le support d'écriture le plus adapté à vos besoins.
  • La configuration optimale du support : Un ensemble d'étapes clés est fourni pour garantir une configuration conforme aux critères des institutions d'enseignement supérieur.
 

 

Auteur(s) / Formateur(s): Groupe de travail FormaDoct
Production cours: Xavier Divet - Ingénieur pédagogique
Public cible: Doctorants, toutes personnes intéressées par les problématiques IST
Mise à jour: 18 septembre 2024
Durée estimée: 3 heures
Prérequis: aucun
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Publications scientifiques, Méthodologie de la thèse
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

Ce module traite de la structuration de vos idées et contenus à travers les point suivants :

  • L'élaboration du plan
  • L'organisation du corps du texte
  • La bibliographie
  • Des conseils de rédaction
  • Un rappel sur les termes importants
Auteur(s) / Formateur(s): Groupe de travail FormaDoct
Production cours: Xavier Divet - Ingénieur pédagogique
Public cible: Doctorants, toutes personnes intéressées par les problématiques IST
Mise à jour: 18 septembre 2024
Durée estimée: 3 heures
Prérequis: aucun
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Publications scientifiques, Méthodologie de la thèse
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

Cet espace de cours référence de nombreux outils utiles aux doctorants

Logiciels de dessins pour les figures, outils de transcription, aide à la carte mentale etc.

Dans ce chapitre nous relayons également les formations disponibles sur Callisto pour créer différents supports comme : les GIF, les posters scientifiques.

Auteur(s) / Formateur(s): Groupe de travail FormaDoct
Production cours: Xavier Divet - Ingénieur pédagogique
Public cible: Doctorants, toutes personnes intéressées par les problématiques IST
Mise à jour: 18 septembre 2024
Durée estimée: 3 heures
Prérequis: aucun
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Nombre d'inscrits: 3
Catalogue: Oui
Thématique: Méthodologie de la thèse
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

This module explains why you need to set up a digital ID as a researcher and how to go about creating one.The primary purpose of digital ID is to increase the visibility of your work and give you recognition as an expert in a given field. The institutions that employ researchers also need to keep track of their scientific output, particularly in the context of national reviews. The module will help you devise a comprehensive, consistent and lasting strategy to organize your digital ID.

The first part of the module focuses on practical digital ID creation details. The second part deals with

  • Creating your academic IDs
  • Developing your online visibility
  • Promoting your work and communicating on your thesis

This course is open access!

Traduction : Daniel Toudic

Auteur(s) / Formateur(s): Équipe FormaDoct
Public cible: Doctorants
Date de publication: 23 juin 2025
Durée estimée: 2h
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Recours à une IA: Certaines illustrations ont été générées avec Le Chat - Mistral AI
Catalogue: Oui
Thématique: Méthodologie de la thèse, Identifiants / Référentiels, Communication / médiation scientifique
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

Dans ce module, nous verrons pourquoi et comment se créer une identité numérique de chercheur. L’enjeu principal est de donner une visibilité à vos travaux pour être reconnu comme spécialiste d’un domaine. Il est également essentiel pour les tutelles de recenser la production scientifique de leurs chercheurs notamment dans un contexte des évaluations nationales. Ce module vous permettra d’organiser votre identité numérique dans le cadre d'une stratégie globale, cohérente et pérenne.  

Dans un premier temps vous découvrirez concrètement comment construire votre identité numérique. La valorisation de votre recherche fera l’objet d’une seconde partie.

Objectifs pédagogiques

  • Créer ses identifiants académiques
  • Développer sa visibilité en ligne
  • Promouvoir ses travaux et communiquer sur sa thèse
Auteur(s) / Formateur(s): Équipe FormaDoct
Public cible: Doctorants
Date de publication: 23 juin 2025
Durée estimée: 2h
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Recours à une IA: Certaines illustrations ont été générées avec Le Chat - Mistral AI
Catalogue: Oui
Thématique: Méthodologie de la thèse, Identifiants / Référentiels, Communication / médiation scientifique
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès, Auto-inscription
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

This course deals with research integrity:

  • It includes a list of fifty questions, derived from students’ FAQs, reviewing the definitions of key terms and covering practical case scenarios.
  • The questions are grouped under ten different sections, complete with a quiz to test your skills.


Traduction : Société ALPHABETS

Auteur(s) / Formateur(s): Alexandre Serres - Ex-Référent intégrité scientifique Université Rennes 2
Production cours: Xavier Divet • Philippe Jaricot - Ingénieur pédagogique
Public cible: Doctorants, toutes personnes intéressées par les problématiques IST
Date de publication: 8 octobre 2024
Durée estimée: 2 heures
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Recours à une IA: Traduction de certains extraits avec DeepL
Catalogue: Oui
Thématique: Éthique et Intégrité scientifique
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

Ce cours est consacré à l'intégrité scientifique :

  • À travers une liste de cinquante questions, inspirée par les interrogations récurrentes des étudiants, nous clarifions les définitions des termes importants et traitons de cas pratiques.
  • Les questions traitées sont réparties en dix ensembles à la fin desquels vous trouverez un quiz pour tester vos connaissances à propos du contenu proposé.
Auteur(s) / Formateur(s): Alexandre Serres - Ex-Référent intégrité scientifique Université Rennes 2
Production cours: Xavier Divet - Ingénieur pédagogique
Public cible: Doctorants, toutes personnes intéressées par les problématiques IST
Date de publication: 8 octobre 2024
Durée estimée: 2 heures
Licence: CC BY-NC-SA
Open badge: Non
Recours à une IA: Traduction de certains extraits avec DeepL
Catalogue: Oui
Thématique: Éthique et Intégrité scientifique
Durée: Format long (> 1h30)
Type d'accès: Libre accès
Partenaire: FormaDoct
Langue: Français

Ce J.e-cours présente une introduction au RGPD, notions essentielles (finalité, registre de traitement, minimisation, etc.), cycle de vie des données, un exemples concrets issus d’établissements. Il s'adresse aux acteurs du circuit des thèses afin de mieux comprendre, appliquer et promouvoir le respect du RGPD auprès des doctorants, encadrants et chercheurs.

Auteur(s) / Formateur(s): Marie-Hélène Noël, DPO de l’UPEC / Rebecca Rousseau, adjointe DPO-RSSI de l’Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne
Responsable(s) pédagogique(s): Abes
Date de publication: 20 novembre 2025
Durée estimée: 01h09
Licence: CC BY-NC
Open badge: Non
Catalogue: Oui
Thématique: Données de la recherche, Méthodologie de la thèse, Éthique et Intégrité scientifique, Aspects juridiques
Durée: Format moyen (1h - 1h30)
Type d'accès: Libre accès
Partenaire: Abes
Langue: Français